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Détection d’un nouveau virus de la grippe aviaire à potentiel pandémique

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La santé publique mondiale continue d’être menacée par la grippe zoonotique et pandémique. Le virus a un taux de mutation élevé, en raison de sa transmissibilité et de son adaptabilité interspécifiques. Le virus de la grippe A a des origines aviaires et animales diverses avec plusieurs sous-types viraux ; ceux des oiseaux aquatiques diffèrent par la neuraminidase (N1-N9) et l’hémagglutinine (H1 – H16).

Les sous-types H6 et H9 du virus de la grippe A infectent le gibier à plumes comme les faisans, les cailles et les poulets domestiques. Les virus H9N2 contenant les gènes acquis de la neuraminidase (NA) et de l’hémagglutinine (HA) génèrent les virus H5N1, H5N6, H10N8 et H7N9 qui peuvent infecter la volaille et menacer ainsi une autre épidémie zoonotique et le déclenchement d’une pandémie.

L’étude

Une étude virologique récente publiée dans le Maladies infectieuses émergentes a identifié le nouveau virus de la grippe A (H3N8) chez des volailles vivantes à Hong Kong, génétiquement similaire aux virus zoonotiques H3N8 signalés en Chine continentale et dont l’origine s’apparente aux virus H5N1, H5N6, H10N8 et H7N9. En outre, une approche d’évaluation des risques a été décrite pour estimer les effets de l’immunité stratifiée selon l’âge humain dans une population.

Étude: Nouveau virus zoonotique de la grippe aviaire A(H3N8) chez le poulet, Hong Kong, Chine. Crédit d’image : krugloff/Shutterstock

Résultats

L’étude impliquait une surveillance virologique entre décembre 2021 et mars 2022. Le virus de la grippe A(H3N8) a été identifié dans des échantillons prélevés dans quatre élevages (AD) pendant la durée de l’étude. Les quatre fermes étaient sérologiquement positives pour les infections H3N8 passées. Par conséquent, les gardiens ont été invités à désinfecter soigneusement leurs fermes et à renforcer leurs mesures de biosécurité. Des tests de suivi ont été effectués en mai 2022 et à nouveau fin juin 2022 ; les quatre fermes ont été testées négatives pour le virus de la grippe A(H3N8).

Entre janvier et juin 2022, de nombreux écouvillons d’eau potable provenant de cages à volailles, de plumeuses, de déjections fécales et de planches à découper ont été prélevés sur des étals et des marchés. Un échantillon sur écouvillon d’une machine à plumer et une planche à découper provenant de deux marchés de volailles vivantes différents étaient positifs au H3N8. Le code-barres ADN a déterminé que le virus détecté dans les échantillons d’écouvillonnage provenait de poulets domestiques.

L’analyse phylogénétique du génome complet des virus isolés de la grippe A (H3N8) a révélé une relation étroite entre les virus H3N8 isolés dans les fermes et les marchés de la volaille et une souche virale H3N8 impliquée dans l’épidémie zoonotique en Chine continentale. Les segments de gène polymérase acide, non structurale, NA, polymérase basique 1 et 2 et M étaient identiques à la sous-lignée G57 du virus H9N2 trouvé en Chine continentale. Les séquences du gène HA sont dérivées de la lignée aviaire eurasienne H3, que l’on trouve chez les oiseaux sauvages et les canards.

Analyse phylogénétique des virus de la grippe A (H3N8) isolés dans des élevages de poulets, des marchés de volailles vivantes et les zones humides de Mai Po, Hong Kong, Chine (gras).  A) Segment de gène de l'hémagglutinine ;  B) segment de gène de la neuraminidase ;  C) segments de gène de base de la polymérase 2.  Les souches ont été analysées avec d'autres données pertinentes sur la séquence virale disponibles dans les bases de données publiques (numéros d'accès dans le tableau en annexe).  Les arbres ont été générés en utilisant IQ-tree (https://www.iqtree.org) avec le modèle général réversible en temps plus gamma.  Les valeurs bootstrap > 80 % sont affichées.  Les barres d’échelle indiquent les distances génétiques estimées.” class=”rounded-img” src=”https://d2jx2rerrg6sh3.cloudfront.net/images/news/ImageForNews_723993_16619931129405267.jpg” srcset=”https://d2jx2rerrg6sh3.cloudfront.net/image-handler/ts/20220831084514/ri/900/src/images/news/ImageForNews_723993_16619931129405267.jpg 900w, https://d2jx2rerrg6sh3.cloudfront.net/image-handler/ts/20220831084514/ri/850/src/images/news/ImageForNews_723993_16619931129405267.jpg 850w, https://d2jx2rerrg6sh3.cloudfront.net/image-handler/ts/20220831084514/ri/650/src/images/news/ImageForNews_723993_16619931129405267.jpg 650w, https://d2jx2rerrg6sh3.cloudfront.net/image-handler/ts/20220831084514/ri/450/src/images/news/ImageForNews_723993_16619931129405267.jpg 450w” sizes=”(min-width: 1200px) 673px, (min-width: 1090px) 667px, (min-width: 992px) calc(66.6vw – 60px), (min-width: 940px) 900px, (min-width: 480px) calc(100vw – 40px), calc(100vw – 30px)” style=”width: 900px; height: 952px;” width=”900″ height=”952″/></p>
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La séquence du gène NA de H3N8 chez la volaille A provenait de la lignée nord-américaine. D’autre part, la séquence N8 NA détectée par code-barres ADN d’un virus provenant d’un échantillon fécal à Hong Kong en 2018 était dérivée du canard pilet du Nord ou Anas aigua.

Deux virus H3N8 provenant d’échantillons de déjections fécales de Hong Kong étaient liés au Canard souchet ou Anus clypeata ; ces souches n’étaient pas apparentées au poulet H3N8 dans tous les segments de gènes. Une similitude a été trouvée entre la séquence du segment du gène N8 et le virus H3N8 d’autres oiseaux aquatiques en Chine continentale. À l’exception du segment de gène N8 NA, aucun autre segment de gène détecté dans le virus de la grippe aviaire A(H3N8) ne provenait du virus H3N8 de l’oiseau sauvage de Hong Kong.

Le référencement a été effectué des titres HI avec l’antisérum de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) contre A/Switzerland/8060/2017 contre le virus A/chicken/MKT-AB13cp/2020 H3N8 et sur la comparaison avec le virus homologue A/Switzerland/8060/2017 . Une réactivité croisée antigénique limitée a été notée entre le nouveau virus de la grippe aviaire A(H3N8) et les virus humains saisonniers H3N2.

La séroprévalence globale était insignifiante dans les échantillons de sérum humain stratifiés selon l’âge. En revanche, une séroprévalence élevée dans les mêmes échantillons de sérum a été observée dans un récent virus de la grippe saisonnière A (H3N8) chez l’homme.

L’immunité collective est un paramètre important lors de l’évaluation de toute menace pandémique d’origine zoonotique.

Conclusion

Selon l’étude, le virus de la grippe (AH3N8) a été détecté parmi les volailles à Hong Kong. Ce virus pourrait constituer une grave menace zoonotique et pandémique. Par conséquent, il est recommandé que la surveillance des volailles pour ce virus soit renforcée, qu’une évaluation complète des risques soit menée et que des souches vaccinales pandémiques de semence soient préparées si nécessaire.

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