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La plus grande étude à ce jour identifie de nouveaux gènes de l’autisme – Actualités

Written by admin

31 août 2022

Une étude a identifié de nouveaux gènes liés à l’autisme et à d’autres troubles neurodéveloppementaux

Les troubles du spectre autistique touchent environ 2 % des enfants aux États-Unis. Alors que la plupart des cas sont héréditaires, un petit nombre sont le résultat de variations génétiques rares. Une nouvelle étude fournit les résultats de la plus grande analyse génétique à ce jour pour comprendre la génétique derrière l’autisme et d’autres conditions neurodéveloppementales. Les résultats révèlent 185 gènes associés à l’autisme, dont beaucoup pour la première fois. L’étude a été publiée dans le numéro du 18 août de la revue Génétique naturelle.

L’étude a examiné les génomes de plus de 150 000 participants. De ce groupe, 20 000 ont reçu un diagnostic d’autisme. Les résultats offrent l’analyse la plus complète des diverses formes de variation génétique dans l’autisme et donnent un aperçu des racines moléculaires du développement cérébral et de la neurodiversité, présentant de nouvelles pistes de recherche potentielles pour comprendre la biologie de l’autisme.

« Bénéficiant d’une collaboration internationale et d’une collecte massive de données, nous avons identifié des centaines de gènes qui peuvent être poursuivis dans d’autres études sur l’autisme », a déclaré le co-auteur principal. Catherine Roederprofesseur UPMC de statistiques et sciences du vivant à Département de statistique et science des données à l’Université Carnegie Mellon. “Grâce à ces découvertes, nous commençons à comprendre comment ces gènes et ces variations génétiques exercent leurs effets au cours du développement neurologique.”

Cette étude bénéficie de nouvelles méthodes d’analyse de données axées sur les sections des parties du génome codant pour les protéines, appelées exome. Pour révéler les variantes génétiques associées à l’autisme, les chercheurs ont analysé les données de séquençage de l’exome de l’Autism Sequencing Consortium, du projet SPARK (Simons Foundation Powering Autism Research) et de la Lundbeck Foundation Initiative for Integrative Psychiatric Research. Cette approche a généré de grands volumes de données qui ont été analysées à l’aide de l’informatique en nuage pour identifier les changements qui pourraient être associés aux variations génétiques liées à l’autisme.

“Les ressources mises en commun par cette collaboration nous ont permis d’extraire plus efficacement des informations à partir de données génétiques et de commencer à démêler la relation entre l’autisme et d’autres troubles du développement, nous rapprochant de la compréhension de la neurobiologie fondamentale de l’autisme”, a déclaré le co-auteur principal Bernie Devlin. , professeur de psychiatrie et de sciences cliniques et translationnelles à l’Université de Pittsburgh.

L’équipe a identifié 185 gènes significativement associés à l’autisme. De nombreuses variantes étaient nouvelles et n’étaient pas héritées des parents. Les variations résultaient de la perte d’une copie d’un gène, de la modification de l’orthographe d’un gène ou de copies en double qui pouvaient toutes altérer la fonction d’un gène.

Les chercheurs ont comparé les variantes de l’autisme nouvellement identifiées à un vaste ensemble de données de 31 000 familles dans lesquelles un enfant a été diagnostiqué avec un retard de développement et/ou d’autres conditions neurodéveloppementales. Ils ont trouvé un grand chevauchement entre les gènes nouvellement identifiés et d’autres conditions associées au retard de développement.

Dans cette étude, Roeder s’est concentré sur l’expression du gène dans les neurones humains en développement. Elle a déterminé que les gènes liés principalement au retard de développement ont tendance à être actifs au début du développement neuronal. À l’inverse, les gènes liés à l’autisme ont tendance à jouer un rôle dans les neurones plus matures.

De plus, l’équipe a découvert que le sous-ensemble de gènes qui sont plus fortement liés à l’autisme montre un certain chevauchement avec des gènes découverts dans une étude antérieure. étude de la schizophrénie. Ce résultat suggère une possible voies biologiques partagées sous-jacentes aux deux conditions.

Avec de nouvelles données attendues prochainement du projet SPARK et des plans d’analyse des données du génome entier comprenant à la fois des séquences codantes et non codantes, les scientifiques espèrent brosser un tableau plus complet de l’architecture génétique de l’autisme et des affections apparentées.

“Ce n’est que la première étape de la découverte”, a déclaré Harrison Brand, co-premier auteur et membre associé du Broad Institute, professeur adjoint de neurologie au Massachusetts General Hospital et à la Harvard Medical School. “Maintenant que nous avons cette liste de gènes de haute confiance, nous pouvons passer à l’étape de modélisation fonctionnelle pour explorer les mécanismes biologiques qui sous-tendent les caractéristiques de l’autisme.”

Roeder et Devlin ont été rejoints dans cette étude par des collègues de la faculté de médecine de l’Université de Pittsburgh, du Broad Institute du MIT et de Harvard, de la faculté de médecine Icahn de Mount Sinai et de l’Université de Californie à San Francisco. Le projet, intitulé “Une variation de codage rare donne un aperçu de l’architecture génétique et du contexte phénotypique de l’autisme”, a reçu un financement de la Simons Foundation for Autism Research Initiative, y compris le SSC-ASC Genomics Consortium et le projet SPARK, le National Human Genome Research Institute , l’Institut national de la santé mentale, l’Institut national de la santé infantile et du développement humain et la Fondation Seaver.

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