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Risque d’infection BA.5 chez les personnes exposées à des variantes antérieures du SRAS-CoV-2

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Pour l’éditeur:

Au cours des derniers mois, omicron (B.1.1.529) est devenu la variante dominante du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), affichant un certain degré d’évasion immunitaire.1 Les sous-variantes initiales de l’omicron, BA.1 et BA.2, sont progressivement remplacées par BA.5 dans de nombreux pays, peut-être en raison d’une plus grande transmissibilité et d’une évasion partielle de l’immunité induite par BA.1 et BA.2.2,3 La protection offerte par BA.1 contre l’infection par le sous-variant BA.5 est essentielle car les vaccins adaptés en cours d’essais cliniques sont basés sur BA.1.

Le Portugal a été l’un des premiers pays touchés par une prédominance BA.5. Nous avons utilisé le registre national des maladies à coronavirus 2019 (Covid-19) (SINAVE) pour calculer le risque d’infection par BA.5 chez les personnes ayant une infection documentée avec des variantes passées, y compris BA.1 et BA.2. Le registre comprend tous les cas signalés dans le pays, quelle que soit leur présentation clinique.

Effet protecteur d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 sur une infection par la sous-variante Omicron BA.5.

Comme le montre le panneau A, nous avons identifié les périodes (dans différentes couleurs) où une variante était représentée dans plus de 90 % des isolats de l’échantillon (données du syndrome respiratoire aigu sévère national coronavirus 2 [SARS-CoV-2] surveillance de la diversité génétique4). Les périodes en gris représentent les moments où plus d’une variante était en circulation. Compte tenu de la transition relativement lente entre la dominance par la sous-variante omicron BA.1 et la dominance par la sous-variante omicron BA.2, nous avons regroupé BA.1 et BA.2 dans l’analyse. Nous n’avons inclus aucune personne infectée dans les 90 jours précédant la dominance par la sous-variante omicron BA.5. Le panneau B montre l’efficacité de la protection contre l’infection pendant la période de dominance BA.5 (à partir du 1er juin 2022) chez les personnes ayant une infection dans les périodes de dominance de différentes variantes, comme représenté dans le panneau A, par rapport aux personnes sans aucune infection documentée jusqu’au 1er juin. Les personnes ayant eu deux infections avant le 1er juin n’ont pas été incluses dans l’étude. Les barres 𝙸 représentent les intervalles de confiance à 95 %.

La surveillance génétique nationale du SRAS-CoV-2 a identifié des périodes où différents variants représentaient plus de 90 % des isolats.4 Nous avons identifié toutes les personnes ayant eu une première infection dans les périodes de dominance de chaque variante, pour calculer leur risque d’infection pendant la période de dominance BA.5 (Figure 1A). Nous avons regroupé BA.1 et BA.2 en raison de la transition lente entre les deux sous-variantes dans la population. Enfin, nous avons calculé le risque d’infection par BA.5 pour la population qui n’avait aucune infection documentée avant la dominance de BA.5 (1er juin 2022).

Nous avons constaté qu’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 avait un effet protecteur contre l’infection par BA.5 (Figure 1B et le tableau S1 dans le Annexe supplémentaire, disponible avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org), et cette protection était maximale pour une infection antérieure par BA.1 ou BA.2. Ces données doivent être considérées dans le contexte des percées d’infections dans une population fortement vaccinée, étant donné qu’au Portugal, plus de 98 % de la population étudiée ont terminé la primovaccination avant 2022.

La conception de l’étude ne peut pas éliminer tous les facteurs de confusion (voir la section Discussion dans le Annexe supplémentaire). De plus, une limitation est l’effet putatif du déclin immunitaire dans une population avec une immunité hybride (infection antérieure et vaccination). Nous avons constaté que l’infection par BA.1 ou BA.2 chez les personnes vaccinées offrait une protection plus élevée contre BA.5 que l’infection par des variants pré-omicron, conformément à un rapport récent avec une conception de test négatif.5 Cependant, les infections BA.1 ou BA.2 se sont produites plus près de la période de dominance BA.5 que les infections avec des variantes précédentes. On a l’impression que la protection offerte par une infection antérieure par BA.1 ou BA.2 est très faible, étant donné le nombre élevé d’infections par BA.5 parmi les personnes ayant déjà contracté une infection par BA.1 ou BA.2. Nos données indiquent que cette perception est probablement une conséquence du plus grand nombre de personnes infectées par BA.1 ou BA.2 qu’avec une infection par d’autres sous-variantes, et elle n’est pas étayée par les données.

Dans l’ensemble, nous avons constaté que les percées d’infections par le sous-variant BA.5 étaient moins probables chez les personnes ayant des antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 dans une population hautement vaccinée, en particulier pour les infections antérieures à BA.1 ou BA.2, que chez les personnes non infectées .

João Malato, M.Sc.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal

Ruy M. Ribeiro, D.Phil.
Laboratoire national de Los Alamos, Los Alamos, Nouveau-Mexique

Pedro P. Leite, MD
Pedro Casaca, M.D.
Eugénia Fernandes, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisbonne, Portugal

Carlos Antunes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Valter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisbonne, Portugal

Manuel C. Gomes, Ph.D.
Université de Lisbonne, Lisbonne, Portugal

Luis Graca, MD, D.Phil.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisbonne, Portugal

Soutenu par l’Union européenne Horizon 2020 programme de recherche et d’innovation (numéro de projet ERA, 952377–iSTARS) et par Fundação para a Ciência ea Tecnologia par 081_596653860 et PTDC/MAT-APL/31602/2017 et par Instituts nationaux de la santé subvention R01-AI116868.

Formulaires de divulgation fournies par les auteurs sont disponibles avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org.

Cette lettre a été publiée le 31 août 2022 sur NEJM.org.

Drs. Gomes et Graça ont également contribué à cette lettre.

  1. 1. Qu P, Faraone J., Evans JP, et coll. Neutralisation des sous-variants SARS-CoV-2 omicron BA.4/5 et BA.2.12.1. N anglais J méd 2022;386 :25262528.

  2. 2. YuJ, Collier AY, Rowe M, et coll. Neutralisation des variantes SARS-CoV-2 omicron BA.1 et BA.2. N anglais J méd 2022;386 :15791580.

  3. 3. Cao Y, Yisimayi A, Jian F, et coll. BA.2.12.1, BA.4 et BA.5 échappent aux anticorps provoqués par une infection par omicron. La nature 2022;608 :593602.

  4. 4. Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge. Diversité génétique du nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) au Portugal. (En portugais) 2022 (https://insaflu.insa.pt/covid19).

  5. 5. Altarawneh HN, Chemaitelly H, Ayoub HH, et coll. Protection de l’infection naturelle par le SRAS-CoV-2 contre la réinfection par les sous-variants omicron BA.4 ou BA.5. Juillet 12, 2022 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.11.22277448v1). préimpression.

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